Le Conseil d’Administration du CNP est élu ou désigné par l’Assemblée Générale du CNP d’ORL. Il est composé de 12 membres, désignés à parité public/privé par chacune des trois composantes : la Société Française d’ORL et Chirurgie Cervico-faciale, le Collège Français d’ORL et CCF et le Syndicat National des Médecins spécialisés en ORL et chirurgie cervico-faciale. A titre consultatif, sont adjoints un représentant du Conseil National de l’Ordre des Médecins et un représentant de la section / sous-section du Conseil National des Universités correspondant au DES d’ORL et au Collège Français d’ORL et CCF.
Le CNP est dirigé par un bureau désigné ou élus par le Conseil d’administration selon les mêmes critères de répartition. Il est composé de 6 membres dont le Président, le Vice-président, le Secrétaire général, le Secrétaire Général Adjoint, le Trésorier et le Trésorier adjoint .